Current Members

Principal Investigator

Georgios A. Pavlopoulos obtained his 4-year Diploma in Computer Science from the University of Athens in Greece (2004), his Masters (MRes) degree in Bioinformatics from the University of Leeds - Department of Biochemistry in UK (2005), his PhD in Bioinformatics from the European Molecular Biology Laboratory (EMBL-Heidelberg) (2009) and his MBA, jointly from the Athens University of Economics and Business (AUEB) and the National Technical University of Athens (NTUA) (2022). He has worked as a 2-year postdoctoral fellow at the Catholic University of Leuven - Department of Electrical Engineering, Belgium (2011-2012) and as a bioinformatics instructor and postdoctoral researcher at the University of Crete - Faculty of Medicine (2013-2015) in Greece. During the same period, he served as the elected executive secretary of the Hellenic Society for Computational Biology and Bioinformatics (HSCBB). He then joined DOE Joint Genome Institute of Lawrence Berkeley National Labs in California, USA as a Bioinformatics postdoctoral researcher (2015-2018). Since 2018, he is the Director of Bioinformatics as well as an elected member of the Scientific Board at the Institute of Fundamental Biological Research (IFBR) of the Biomedical Sciences Research Center (BSRC) "Alexander Fleming", Athens, Greece. In parallel, he is the Head of Bioinformatics at the Center of new Biotechnologies & Precision Medicine at the University of Athens, Medical School. He has received competitive grants, has organized many international Bioinformatics conferences in Greece and has published in high impact journals such as Nature, Cell, Science, NAR, Nature Biotechnology and others.
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Ο Γεώργιος Παυλόπουλος είναι Ερευνητής Β’ και επικεφαλής της Βιοπληροφορικής στο Ίδρυμα Βασικής Βιοϊατρικής Έρευνας (Ι.Β.Β.Ε) του Ερευνητικού Κέντρου (Ε.ΚΕ.Β.Ε) "Αλέξανδρος Φλέμινγκ" καθώς και της μονάδας Ιατρικής ακριβείας του τμήματος Ιατρικής του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών (pMedGR). Είναι απόφοιτος του τμήματος Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών του Εθνικού Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών, κατέχει μεταπτυχιακό δίπλωμα στη Βιοπληροφορική από το Πανεπιστήμιο του Leeds της Αγγλίας και διδακτορικό τίτλο από το Πανεπιστήμιο της Χαϊδελβέργης της Γερμανίας, σε συνδυασμό με το Ευρωπαϊκό εργαστήριο Μοριακής Βιολογίας (EMBL). Τέλος, κατέχει μεταπτυχιακό δίπλωμα στη διοίκηση επιχειρήσεων (MBA) από το Οικονομικά Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΟΠΑ) και το Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο (ΕΜΠ). Έχει υπηρετήσει ως Μεταδιδακτορικός Ερευνητής σε ερευνητικά κέντρα και πανεπιστήμια της ημεδαπής και αλλοδαπής, όπως το τμήμα Ιατρικής του Πανεπιστημίου Κρήτης, το τμήμα ηλεκτρολόγων μηχανικών του Πολυτεχνείου τους Λουβένης στο Βέλγιο και το Lawrence Berkeley National Lab (LBNL) των Ηνωμένων Πολιτειών της Αμερικής. Έχει πάνω από 80 δημοσιεύσεις σε διεθνή συνέδρια και περιοδικά υψηλής απήχησης όπως τα Nature, Cell, Science, NAR, Nature Biotechnology ενώ έχει πάνω από 5.500 ετεροαναφορές. H έρευνά του επικεντρώνεται στην ανάπτυξή λογισμικού και συγχώνευση μεγάλου όγκου δεδομένων, ενώ πολύ πρόσφατα μια σχετική του δημοσίευση προτάθηκε για το διεθνές βραβείο Gordon Bell που αφορά εξαιρετικά επιτεύγματα στο χώρο των υπολογιστών υψηλών επιδόσεων. 'Eχει συμμετάσχει στην οργάνωση πολλών εθνικών και διεθνών συνεδρίων υπό την αιγίδα της Ελληνικής Εταιρείας Υπολογιστικής Βιολογίας και Βιοπληροφορικής (HSCBB), στην οποία υπηρέτησε και ως γραμματέας, ενώ εδώ και μια τετραετία υπηρετεί ως εκλεγμένο μέλος του Επιστημονικού Συμβουλίου του Ι.Β.Β.Ε-Ε.ΚΕ.Β.Ε "Αλέξανδρος Φλέμινγκ". Tέλος, ανήκει στη λίστα του 2022 (“Updated science-wide author databases of standardized citation indicators”) η οποία περιλαμβάνει επιστήμονες που τοποθετούνται στο ανώτερο 2% του κλάδου τους παγκοσμίως.

Researchers and Students

Fotis Baltoumas

Postdoctoral Researcher, BSRC "Alexander Fleming" (2020-present)
PhD in Bioinformatics, Faculty of Biology, University of Athens.
MSc in Bioinformatics, Faculty of Biology, University of Athens
BSc in Biology, Faculty of Biology, University of Athens

Eleni Aplakidou

PhD candidate in Bioinformatics, BSRC "Alexander Fleming" & Medical School - University of Crete (2023-present)
MSc in Molecular Medicine, BSRC "Alexander Fleming" & Medical School - University of Athens (2023)
BSc in “Molecular Biology and Genetics”, Democritus University of Thrace (2021)

Yorgos Sofianatos

Marie Curie Fellow: BSRC "Alexander Fleming", Athens, Greece (2020 - 2024)
Postdoctoral Researcher: BSRC "Alexander Fleming", Athens, Greece (2018-2019)
Machine Learning Engineer: Apple Inc, CA, USA
Research Assistant: SLAC National Accelerator Laboratory, CA, USA
PhD in Physics, Stanford University, CA, USA (2009)
BSc in Electrical and Computer Engineering, National Technical University of Athens, Greece

Maria Chasapi

MSc in “Data Science and Information Technologies”, specialization in Bioinformatics-Biomedical Data Science, Department of Informatics and Telecommunications - University of Athens (2023-present)
BSc in “Biology”, University of Athens (2023)

Nikolaos Vergoulidis

MSc in Bioinformatics, Department of Biology, University of Athens, Greece (2023-2024)
Thesis: "Enzyme discovery and engineering through meta-genomic sequence analysis"
BSc in Medical Laboratories / Biomedical Science, University of Thessaly (2014)

Kleio Verrou

Bioinformatics Researcher & PhD candidate
Data Analysis and Bioinformatics Unit, Center of New Biotechnologies & Precision Medicine (pMedGR), Medical School, University of Athens (2019-present)
MSc Bioinformatics, University of Crete, Greece (2018)
BSc Biology, University of Crete, Greece (2015)